总部经济一直是上海力争的一块蛋糕。上海市政府领导曾表示，上海在建设“四个中心”的过程中，一直困惑的问题是，在上海的跨国公司已有400多个，但绝大多数是行政性质的，最有价值的资金运作不在其中，上海这几年一直在探索如何解决这个问题。
    究其原因，复旦大学全球投资与贸易研究中心主任袁堂军表示：“这些跨国公司来到上海之后，还在等待其他制度的配合。到目前为止，中国跟国外经济的主要纽带是在进出口加工贸易上，这个总部意义不大。”不过，他也表示，随着中国经济发展，产业链慢慢拓展，会涉及研发等环节，那么跨国公司有动力来到上海自贸区。
    袁堂军还指出，总部经济还会带来“技术外溢”的效果：“除了能反过来帮助制造业产业链升级之外，对金融服务等，都有整体的提升作用。”