太仓港与上海港将合资成立码头公司，共同经营管理太仓港集装箱三期下游两个5万吨级泊位。同时，双方将在码头操作平台、物流运输体系、通关一体化、信息共享等方面开展对接合作。

　　这意味着，上海港将把外高桥至洋山的中转平台移植到太仓港，引导苏锡常地区集装箱“弃路改水”从太仓港出运。另外，原本到外高桥集并的重庆、武汉等长江中上游地区外贸集装箱，将调整至太仓港集并中转，仅此一项，太仓港每年预计可增加吞吐量60万标箱。按计划，首批8艘中转驳船预计于6月初运营。

　　在两港合作之前，大部分苏锡常地区外贸货物主要通过集卡陆路直运上海洋山港区或外高桥港区进出，长江中上游地区很大部分外贸货物则通过水路驳运至外高桥，再从外高桥中转洋山港进出。这样不仅费用高、风险大，还给上海的道路交通造成很大压力。而6月开始，将有8艘驳船，每周21班往返太仓和上海，提供更省、更快、更畅、更安全、更环保的远洋中转服务。太仓港与上海港战略合作框架协议还明确，太仓港与上海港将共同引导近洋外贸航线向太仓港转移，力争到今年年底太仓港近洋航线接近每周20班，开辟日本、韩国和台湾地区航线。

　　物流便捷之外，太仓港和上海港之间将实现通关一体化；江苏企业在太仓港与洋山港之间的中转货物，无论进口还是出口，仅需在太仓港办理通关手续，真正实现货物进出口只需“一次申报、一次查验、一次放行”。此外，两港正打造统一信息平台，以后，企业可为太仓港中转洋山港的货物办理装卸、转运、通关等所有手续，并进行在线全程动态跟踪，太仓和上海两地海关作业状态可以进行信息查询。

　　港口间实现战略合作后，太仓还希望能由此“沾上”上海航运发展综合试验区和上海自贸试验区的“溢出效应”。

　　早在2012年，太仓港口管委会与太仓市政府、江苏省交通运输厅联合委托上海组合港办公室，开展了“太仓港纳入上海国际航运发展综合试验区和自贸区方案研究”。如今，太仓港正加强与太仓港综保区、园区综保区、昆山两岸产业合作试验区等特殊监管区域的“区港联动”，积极探索太仓港享受上海航运发展综合试验区乃至上海自贸区相关效应的争取工作。目前，太仓港已开展成为“启运港退税政策”扩大试运港口争取工作。