上海的生物医药产业在国内处于领先的位置，已经形成以张江国家基地为核心，南汇周康、徐汇枫林、星火开发区、青浦开发区为辐射点的产业集聚，形成了产业群体、研究开发、孵化创新、教育培训、专业服务、风险投资六个模块组成的良好的创新创业氛围和人才培养—科学研究—技术开发—中试孵化—规模生产—营销物流的现代生物医药创新体系。但与国外先进国家相比产业规模、科研水平和企业实力方面处于劣势地位。调查显示，上海生物医药产业发展应从以下继续加大力度。
   
    1、选择适合的创新突破口。从产业技术未来的走势看，生物医药产业技术将会成为继信息技术后，最有可能推动人类科技革命的新技术。上海生物医药产业上游科研水平处于国内领先水平，在中药合成、基因工程技术领域积累了一定的优势，但其整体产业规模和产业化水平较低，产业进一步发展需要更多的资金投入。因此，上海应立足产学研一体化和创新平台建设，强化产业化环节的建设，从中药合成和基因工程技术入手，努力实现技术的突破性发展。

    2、加强中小企业的创新支持，拓宽企业的融资渠道。通过间接的产业优惠政策鼓励中小企业与外资、本土研究机构进行横向研发合作，强化中小研发企业集成创新的能力，使各种相关技术有机融合，形成有市场竞争力的产品；政府可以通过增加科技活动的R&D投入，增加创新基金的启动资金规模、为中小企业信用担保、加强税收优惠等方面，加大对中小型研发企业技术创新的支持，努力培育本土的大中型企业。

    3、强化产学研一体化程度，提高创新效率。生物医药业技术产业化过程包括：R&D、中试、生产和市场四个阶段。要实现企业成为科研、开发和引进技术的主体，企业应努力培育自主科技开发力量，在各级政府的帮助和扶持下，打破条块和体制上的界限，实现产学研协作、联合。充分发挥企业技术开发中心、行业技术开发基地和技术转移中心的作用，以企业开发中心为主体，组织产学研紧密围绕生物医药产业关键技术领域，集中进行技术开发，力争实现产业某些技术的跨越式发展。

    4、加快公共服务平台建设，降低企业自主创新成本。由于生物医药产业化所需的巨额资金和现有企业一体化程度低，生物医药企业尤其需要技术、信息交流平台。生物医药试验设备在研发中有重要的作用，中小企业通常无力购买这些设备，因此，需要政府或产业基地投资，搭建中小企业设备共享平台，实现资源共享。目前上海生物医药协会和专利检索系统拥有原始的专利数据库，建议政府建立生物技术与医药化学专利数据库、专利数据电子化服务系统及专利商品化网站等项信息系统，直接与国外知名数据库连结，搜集美、日、欧等国专利信息和文献，缩短专利文献检索的时间。

    上海生物医药产业专利申请成本相对较高，部分企业已开始到国外其它地区申请专利。为此，政府需要实施专利为核心的知识产权战略、加快发展知识产权交易、专利代理等中介服务机构，实行在专利期满前，将销售产品给医院进行临床试验应享有专利免责权，促进科技成果流动扩散和转化。另外，政府应建立生物技术产业技术人才数据库，搭建企业与大学、研究机构人才需求交流的平台，加强高校重点学科建设，逐步建立开放式学科发展体系，鼓励采取大学、企业、研究机构联合培养人才的方法，提高人才的实用性和动手能力，建立产业个人职业信用档案，为企业人才管理创造条件。