近年来，上海生物医药产业保持了年均15%的增幅，产业规模呈现平稳增长态势。全市纳入统计的生物医药生产企业410家，2008年全行业实现经济总量1034.6亿元，增长15.8%。其中：制造业工业总产值为437.3亿元，增长15.6%；医药商业销售收入为547.3亿元，增长14.9%；外包服务业收入为50亿元，增长28.2%。在制造业领域，化学制药工业总产值占44.7%，医疗器械占19.4%，生物制品占10.2%，中药占8.1%，其他占17.6%；初步形成了内资、民营、外资企业共同推进的良好局面，培育了头孢曲松钠、痰热清和麝香保心丸等45个年销售额超过亿元的拳头产品，以及益赛普、丹参多酚酸盐等一批创新产品，成为生物医药产业新的经济增长点。

    同时，上海生物医药创新体系不断完善，形成了由10多所高校、30多家专业研究机构、30多个研发中心（含外资）、30多家新药临床研究基地、200多家研发型企业组成的生物医药创新网络。全市生命科学和生物医药领域有近80位两院院士。十五期间，上海在《科学》、《自然》和《细胞》等国际顶尖刊物上发表的论文约占全国总数的50%。2003－2006年，上海累计获得国家一类新药生产和临床批文48个。