近年来，开发区认真落实科学发展观，高度重视环境保护工作，始终把可持续发展放在全区工作的首位。自2006年国家环保总局批准开发区创建国家级生态工业园示范区以来，开发区在生态发展、和谐发展方面又迈进了一大步，为又好又快发展奠定了坚实的基础。

一是强化绿色招商和环保前置审批，从源头上控制污染源的产生。引进项目要求“三高两低”：科技含量高、产出投入比高、对地方经济贡献高，低污染、低能耗。坚决不引进印染、化工等重污染项目。二是加大环保基础设施建设力度，减少生活源对水体污染负荷。区内已建成并投入正常运行的污水厂有5个，总处理规模达13.5万吨/天，已建成污水管网150公里。两个总量为3.75万吨/天的污水厂工程即将投入试运行。铁南、港东、城区三个污水厂已具备脱磷脱氮深度处理能力。三是加快中水深度回用试点，提高水资源重复利用率。对高水耗的电子行业，采用重金属废水膜处理新工艺进行废水深度处理，实行综合回用，以此削减原有污染物排放量。目前已有嘉联益等四家企业进行试点，设计回用水总量1700吨/天。四是建设工业供水厂，实行分质供水。在光电产业园区规划建立一期生产能力7.5万吨/天的工业供水厂，同时建设工业分质供水管网，向区内提供水质、水压符合生产要求的工业用水，以节约饮用水用量，缓解昆山市饮用水供水紧张的局面。五是建设夏驾河景观带，实现自然生态和人文景观的高度融合。实施夏驾河生态景观建设工程，将通过植物、动物、微生物等生物生态的水处理方式对整个夏驾河水质进行自然净化，逐步改善该地区生态环境。