长江三角洲地区近年来经济社会发展活跃，口岸外贸和海关税收均已占中国总量的四成。

据海关总署统计，２００６年，通过长三角口岸的进出口贸易达７１４７亿美元，比上年增长２４．３％，约占全国外贸总额的４１％，其中，约６４１亿美元的进出口来自长三角以外的其
他省区市；上海、南京、杭州、宁波四大直署海关２００６年完成税收２４５８亿元人民币，比上年增长１１．４％，占全国海关税收总额的４０．３％。

２００６年，长三角四大海关共监管进出口货运量４．１８亿吨，审核报关单１７１１万份，比上一年分别增长１０．８％和２０．２％，分别占全国总量的２３．７％和３８．５％。

在深化通关作业改革方面，长三角地区海关近两年先后实施了提前报关、无纸通关、空运直通式通关、便捷通关、特定区域快速通关等项目。目前长三角地区海关网上税费支付业务已推广至１２家银行，其中上海口岸税费电子化支付率已提高至７２％。

长三角共有８个沿海主要港口、２６个内河规模以上港口。